Program shalat tahajjud adalah program yang dilaksanakan setiap hari di asrama yang dikontrol oleh wali kamar. Pelaksanaannya dimulai dari pukul 03.45 Wib dengan berjamaah
maupun secara individu di kamar masing-masing. Tahajjud merupakan salah satu program ibadah sunnah yang diwajibkan untuk melatih santri beribadah malam. Selain ibadah wajib
santri juga melaksanakan ibadah sunnah pada malam hari seperti Tahajjud.