Munaqasyah adalah program yang dilaksanakan setiap dua kali dalam satu semester. Setiap santri yang di Munaqasyah diadakan bimbingan terlebih dahulu oleh ustadz/ustadzah wali kamar dan guru tahfidz. Bagi santri yang direkomendasikan oleh pembimbing maka santri bisa lanjut munaqasyah sesuai dengan hafalan yang telah disetujui oleh pembimbing. Munaqasyah dilaksanakan sebelum ujian semester dijadwalkan. Munaqasyah pada semester ini dilaksanakan pada tanggal 13 Februari 2026 yaitu gelombang I dan II Jilid 14 karena pada bulan Desember tahun 2025 terjadi bencana alam (banjir bandang) di Padang yang mengakibatkan kegiatan jadwal Munaqosah ditunda sampai bulan Februari 2026. santri yang ikut sebanyak 110 orang untuk SMP dan untuk SMA sebanyak 69 orang. Munaqasyah SMP dan SMA dilaksanakan selama 5 hari. Pelaksanaan munaqasyah tersebut dibagi 10 titik, kegiatan tersebut dimulai dari pukul 08.00 Wib sampai pukul 15.00 Wib. Setiap santri yang munaqasyah diuji oleh dua orang penguji dan setelah selesai munaqasyah santri akan mendapatkan sertifikat jika lulus dalam munaqasyah. Santri SMP dan SMA yang munaqasyah akan diwisudakan pada waktu perpisahan sekolah yang dihadiri oleh orang tua.
